在這次“南粵水更清”行動計劃中，對畜禽養(yǎng)殖污染的治理是十分重要的一個方面。對此，農(nóng)業(yè)部門就表示將通過進一步擴大禁養(yǎng)范圍、推廣集中飼養(yǎng)等方式，從源頭上防止畜禽養(yǎng)殖對水域造成污染。
從2008年開始佛山南海區(qū)就已經(jīng)著手畜禽養(yǎng)殖污染整治工作，到2011年，全區(qū)已關(guān)停畜禽養(yǎng)殖廠4330個，搬遷生豬41萬多頭，拆遷畜禽欄舍面積160萬平方米，但是由于當初并沒有將全部主干河涌的周邊納入禁養(yǎng)范圍，導致邊遠地一些依河而建的畜禽養(yǎng)殖場依然存在。
區(qū)農(nóng)林漁業(yè)局強調(diào)，所有禁養(yǎng)區(qū)內(nèi)的畜禽養(yǎng)殖場必須在10月31日之前完成搬遷，而對適養(yǎng)區(qū)內(nèi)一些符合條件的養(yǎng)殖場，將推廣集中飼養(yǎng)、集中治污。